翻譯/ 水產前沿雜志 孫旭東 據Shrimp News 9月23日消息，最近，一種引起對蝦急性肝胰腺壞死癥（AHPND）的菌株——弧菌（KC13.17.5）在越南北部地區的蝦中被分離出來。一般認為，AHPND通常是由副溶血弧菌引起的，但是通過對這種被分離出來菌株的基因組測序，表明它屬于哈氏弧菌。該測序數據主要包括質粒序列和假定特征基因序列。  圖片來源于網絡 在越南乃至全亞洲，對蝦養殖都具有很大的經濟價值且發展態勢良好。直到2011年，由于早期死亡綜合征（EMS，科研上稱為對蝦急性肝胰腺壞死癥AHPND）的大規模爆發，對對蝦產業造成巨大影響，對蝦產量也開始急劇下滑。在部分地區AHPND的致死率甚至達到100%，整口蝦塘完全絕收。而后有專家通過PCR（聚合酶鏈式反應）技術鑒定出，引起AHPND的致病菌是副溶血弧菌。并且最早被發現攜帶致病基因的菌株據推測來自泰國和墨西哥。 當時有專家指出，由于AHPND的致病性基因片段被嵌合在質粒上，那么有致病能力的質粒很可能不僅僅只在副溶血弧菌之間傳播，而是在其他種類細菌中也有可能存在。不過在很長一段時間內此說法沒有得到廣泛證實。 此次在越南被發現的AHPND致病菌株，被分離鑒定后證明其屬于弧菌屬，但是其基因序列的某一片段卻表明它并不是副溶血弧菌這個種類。為了進一步研究這株弧菌的基因學特征，其遺傳物質被進一步測序。 專家稱，測序方法有以下幾個步驟：第一，通過DNA樣品制備試劑盒制備基于目的基因的基因文庫；第二，通過實驗室儀器對該文庫進行測序；第三，對測序數據進行組裝并分析；第四，將分析結果與已知的質粒基因和致病性特征基因作比對從而找出同源序列。 結果顯示該菌株的基因組有42個Scaffolds（拼接，分子生物學概念），5288個有效編碼基因。最終的特征鑒定表明與其最接近的菌株是哈氏弧菌（Vibrio harveyi）。同時，使用預測基因的同源性搜索證明，同副溶血弧菌相比該菌株與哈氏弧菌有更高的相似度。測序結果也表示，致病基因位于該菌株的質粒上，通過PCR技術也證明了其可以導致AHPND。 此外，實驗室進一步對該菌株基因組42個Scaffolds的研究，得出該菌株可能是通過獲取帶有致病基因的質粒而產生致病性。對這一說法，相關人士分析，早前副溶血弧菌在對蝦養殖過程中大規模爆發時研究人員作出的推論或被證實。 雖然該報道指出該菌株“最接近”哈氏弧菌，但其細胞內攜帶有導致AHPND的相關質粒和致病性特征基因是肯定的。首先發現該菌株的實驗室稱，該菌株的基因組序列僅僅是與哈氏弧菌序列最為相似，并不等于攜帶著嵌合有致病基因的質粒不可能被傳送到其他種不同的弧菌中。那么本次發現到底是個案還是具有廣泛意義，以及為何基因能夠跨種類傳播？該實驗室表示，目前相關深入研究正在開展當中，最新結果將及時公布從而可以讓廣大水產養殖人士更好的應對AHPND，防止進一步傳播。 【關鍵字】：對蝦，AHPND，EMS，副溶血弧菌，哈氏弧菌，水產養殖網 |
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